機關組織依「法務部矯正署技能訓練所組織準則暨辦事細則」規定，隸屬於法務部矯正署，設簡任所長一人，綜理全所事務；副所長一人，襄助所長處理全所事務；秘書一人，綜核文稿及各科室業務聯繫。下設調查分類、輔導、技能訓練、衛生、戒護、總務等六科，及人事、政風、會計、統計四室。全所員額編制為二四零名，掌理下列事項：

1. 受刑人之調查分類。
2. 受刑人之教育輔導。
3. 受刑人之技訓作業。
4. 受刑人之衛生保健。
5. 受刑人之戒護管理。
6. 受刑人之名籍、給養及保管。
7. 其他有關技能訓練所管理事項。

組織系統圖